ولد العام 1878 في فيينا - النمسا. تتلمذ على يد جده شلومو بوبر، وتأثر منه. درس الفلسفة وتاريخ الفن في جامعات فيينا ولايبزغ وبرلين وزيوريخ بين 1896 و0091، وخلال فترة دراسته وبعدها كتب وحرر في مجلة (دي فولت) لسان حال المنظمة الصهيونية. انتقل بوبر إلى برلين العام 1906 فدرس
فيها الفلسفة الدينية. أسس وحرر مجلة (دير يودي) بين 1916 و 1924، وهذه المجلة أصبحت لسان حال يهود المانيا. ثم تولى تدريس مواد الفلسفة الدينية اليهودية في جامعة فرانكفورت بين 1923 و 1933. وعند اعتلاء هتلر سدة الحكم في المانيا غادرها إلى فلسطين حيث انخرط في التعليم في الجامعة العبرية في القدس.
وكان بوبر انضم الى الحركة الصهيونية العام 1898 وكان عضواً في مؤتمراتها، ولعب دوراً فكرياً ملحوظاً في الدعوة إلى ضرورة تجديد الإبداع الفكري والروحي بين اليهود، وكان له تأثير على الشبيبة اليهودية في وسط أوروبا، حيث رأوا فيه زعيماً روحياً وفكرياً.
وكان بوبر أحد زعماء (بريت شالوم) (تحالف السلام)، وهي حركة نادت بالتسامح والتقارب في علاقة الحركة الصهيونية مع الحركة القومية العربية.
أمّا على صعيد التأليف فإنه قام بترجمة التوراة إلى الألمانية. وكتب عدة مؤلفات، منها: (اور غانوز) (نور مخفي)، (غوغ وماغوغ)، (أنا وأنت)، (تورات هنفيئيم) (توراة الأنبياء)، (موشي) (موسى) وغيرها من الكتب والمقالات.
ومن أهم آرائه أنه يرى أن الإيمان هو عبارة عن محادثة بين الإنسان والله.
توفي في القدس العام 1965. وأُقيم على اسمه معهد مارتين بوبر لدراسات الأديان.
